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Communiqué de presse

Enfants et adolescents en rechute d’un cancer : l’espoir de nouvelles thérapeutiques grâce au séquençage du génome tumoral

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Villejuif, le 17 mars 2022

Analyser l’ensemble des gènes codants de la tumeur (Séquençage des exons) pour trouver
une ou plusieurs anomalies des gènes tumoraux permet non seulement de mieux
comprendre la maladie pour mieux la traiter, mais aussi d’orienter les enfants et adolescents
vers de nouvelles options de traitement au moment de la rechute. C’est ce que démontre
l’étude MAPPYACTS, grand essai européen mené dans 4 pays, promu par Gustave Roussy
et coordonné par la Dr Birgit Geoerger, oncopédiatre à Gustave Roussy et la Dr Gudrun
Schleiermacher, oncopédiatre à l’Institut Curie.

Présentés le 12 avril prochain au congrès annuel de l’AACR par le Dr Pablo Berlanga,
oncopédiatre à Gustave Roussy, et publiés en amont dans la revue Cancer Discovery, les
résultats finaux de MAPPYACTS posent les bases de l’accès à une médecine personnalisée
de précision pour les plus jeunes atteints de cancer quand le traitement classique a échoué.
La pérennisation du séquençage du génome entier en routine clinique est dorénavant
assurée grâce au plan Médecine France Génomique 2025.

Publication avancée en ligne le 16 mars dans Cancer Discovery :
https://aacrjournals.org/cancerdiscovery/article/doi/10.1158/2159-8290.CD-21-1136

Le taux de guérison des cancers survenant pendant l’enfance ou l’adolescence dépasse les 80 %.
Cependant, en cas de rechute ou de résistance au traitement standard, les options thérapeutiques
sont limitées et le cancer reste la première cause de décès par maladie chez l’enfant et l’adolescent.
Permettre aux plus jeunes d’avoir accès à l’innovation thérapeutique reste un enjeu majeur dans la
prise en charge de leur maladie.

Pour un patient, séquencer le génome de sa tumeur aide aujourd’hui à orienter les décisions
thérapeutiques. C’est la médecine de précision. L’agrégation de tous ces séquençages permet aux
chercheurs de mieux comprendre le cancer et de rechercher de nouvelles voies thérapeutiques.
MAPPYACTS est un programme de recherche clinique dont l’objectif était d’étudier les
caractéristiques génétiques des tumeurs ou des leucémies d’enfants et adolescents qui
n’ont pas répondu ou qui ont récidivé après le premier traitement, afin de les orienter vers
de nouveaux médicaments, notamment les thérapies ciblées.

Cette étude internationale et prospective de médecine de précision a inclus 787 patients âgés de
6 mois et plus entre février 2016 et juin 2020 en France, Italie, Irlande et Espagne. Tous étaient
atteints d’une tumeur maligne ou leucémie, en rechute ou réfractaire après le premier traitement
standard.

Pour définir le profil moléculaire du cancer au moment de la rechute et savoir si les variations
génétiques sont spécifiques de la maladie, le séquençage de l’ensemble du génome a été réalisé
à partir d’une biopsie de tissus tumoraux et comparé au séquençage d’un tissu normal du patient.
Ces analyses ont pu être réalisées grâce à l’expertise des biologistes contribuant au programme.

L’objectif était de discuter des résultats du séquençage dans le cadre d’une réunion de concertation
pluridisciplinaire (RCP) moléculaire nationale afin de recommander, lorsque c’était possible, un
traitement sur-mesure adapté à chaque patient, soit déjà autorisé, soit évalué dans le cadre d’un
essai clinique.

Les résultats du séquençage ont aussi alimenté une base de données moléculaires et 50 projets
de recherche sont actuellement en cours afin de mieux comprendre les cancers de l’enfant et de
l’adolescent en utilisant les données de MAPPYACTS.

Déterminer le traitement ciblé le plus adapté

L’analyse de l’ensemble des gènes de la maladie par séquençage haut débit a permis de trouver
chez 69 % des patients (432 patients sur les 632 qui avaient pu avoir le séquençage de leur tumeur)
une ou plusieurs anomalies susceptibles d’être spécifiquement ciblées par un nouveau
médicament.

Près d’un tiers (30 %) de ces patients ont ainsi pu bénéficier d’une nouvelle proposition
thérapeutique après discussion en RCP moléculaire nationale et ont reçu au moins une thérapie
ciblée, soit seule, soit en combinaison avec une chimiothérapie ou une autre thérapie ciblée. Plus
de la moitié (57 %) de ces traitements innovants étaient administrés dans le cadre de l’essai
thérapeutique européen AcSé-ESMART.

Le taux de réponse (régression tumorale) de tous les patients ayant reçu une thérapie adaptée à
leur profil génomique était de 17 %, et 41 % présentaient une stabilisation de la maladie. Le taux
de réponse s’élevait à 38 % lorsque le médicament administré avait un niveau de preuve très élevé
de son efficacité tel que défini par l’échelle ESCAT de l’ESMO qui a été adaptée à la situation
pédiatrique pour cette intention.

Ce grand essai international de médecine de précision MAPPYACTS démontre que le séquençage
du génome tumoral chez les enfants et adolescents est non seulement faisable en clinique mais
qu’il apporte une ressource thérapeutique supplémentaire au moment de la rechute. Il a installé la
médecine de précision dans la prise en charge des enfants et adolescents atteints de cancer.

Surtout, ces modifications du génome actionnables par un médicament présentant un très haut
niveau de preuve devraient être recherchées dès le diagnostic.

Par ailleurs, cette initiative démontre l’importance de développer des essais cliniques pédiatriques
évaluant des thérapies innovantes afin de pouvoir proposer davantage d’options de traitement.
Avec d’ores et déjà deux des 12 plateformes déployées sur le tout le territoire, le plan Médecine
France Génomique 2025 permet aujourd’hui le séquençage du génome entier dans le cadre du
soin pour une prise en charge diagnostique et thérapeutique personnalisée lors d’une rechute ou
en cas d’échec thérapeutique pour les adultes et tous les enfants et adolescents en France.

Une première étape vers la biopsie liquide chez les enfants et adolescents

Une biopsie liquide est une prise de sang dans laquelle on retrouve des fragments d’ADN (donc de
gènes) provenant des cellules tumorales du patient. Geste simple, la question est de savoir si la
biopsie liquide pourrait un jour se substituer à la biopsie tumorale.

Dans le cadre d’une recherche du programme MAPPYACTS, les médecins-chercheurs ont ainsi
évalué la biopsie liquide chez 225 des jeunes patients atteints de tumeurs en dehors du système
nerveux central pour rechercher les modifications dans l’ADN tumoral circulant. Aucune décision
thérapeutique n’a été prise à partir des résultats de cet examen.

Le séquençage a pu être réalisé avec succès sur l’ADN tumoral circulant de 56% (128/225) de ces
patients, et 76% des altérations actionnables présentes dans la tumeur ont été retrouvées dans la
biopsie liquide. Les médecins-chercheurs ont découvert ainsi 94 mutations potentiellement
exploitables, parmi lesquelles 35 n’avaient pas été détectées lors du séquençage du tissu tumoral.
Outre le fait que la biopsie liquide pourrait épargner une procédure invasive chez certains jeunes
patients, elle apporte de nouveaux éléments en rendant également compte de l’hétérogénéité
tumorale.

Cette étude est la première à explorer le rôle de cette technique innovante pour l’analyse d’ADN au
sein de la population pédiatrique. La suite de cette recherche et des études complémentaires seront
effectuées dans le cadre de l’étude MAPPYACTS ².

L’étude MAPPYACTS a été financée par l’Institut National du Cancer (PHRC INCa-DGOS_8519
MERRI), la Fondation ARC, l’association Imagine for Margo, la Fédération Enfants et Santé, la
Société Française de Lutte contre les cancers et les Leucémies de l’Enfant et de l’adolescent
(SFCE), Dell, la Fondation Annenberg, l’Association Hubert Gouin Enfance et Cancer, Meghanora,
Fundacion FERO, Fundacion Rotary, le programme de soutien Parrain-Chercheur pour Birgit
Geoerger et la campagne « Guérir le cancer de l’enfant au 21e siècle » menés par Gustave Roussy.

Source :
Cancer Discovery
Publication avancée en ligne mercredi 16 mars 2022
The European MAPPYACTS trial : Precision Medicine Program in Pediatric and Adolescent
Patients with Recurrent Malignancies
https://aacrjournals.org/cancerdiscovery/article/doi/10.1158/2159-8290.CD-21-1136

Auteurs
Pablo Berlanga*1, Gaelle Pierron*2, Ludovic Lacroix*3, Mathieu Chicard4, Tiphaine Adam de Beaumais5,
Antonin Marchais6, Anne C Harttrampf1, Yasmine Iddir4, 7, Alicia Larive8, Aroa Soriano Fernandez9, Imene Hezam1, Cecile Chevassus8, Virginie Bernard10, Sophie Cotteret3, Jean-Yves Scoazec3, Arnaud Gauthier11, Samuel Abbou1, Nadege Corradini12, Nicolas André13,14, Isabelle Aerts15, Estelle Thebaud16, Michela Casanova17, Cormac Owens18, Raquel Hladun-Alvaro19, Stefan Michiels8, Olivier Delattre4, 10, 15, Gilles Vassal5, Gudrun Schleiermacher **4, 15 , Birgit Geoerger**1,6
* co-first authors
** co-last authors

Affiliations
1 Department of Pediatric and Adolescent Oncology, Gustave Roussy Cancer Campus, Université Paris-Saclay, Villejuif,
France
2 Unité de Génétique Somatique, Service de Génétique, Hospital Group, Institut Curie, Paris, France
3 Department of Pathology and Laboratory Medicine, Translational Research Laboratory and Biobank, AMMICA, INSERM
US23/CNRS UMS3655, Gustave Roussy Cancer Campus, Université Paris-Saclay, Villejuif, France. 4 INSERM U830, Laboratoire de Génétique et Biologie des Cancers, Research Center, PSL Research University, Institut
Curie, Paris, France.
5 Clinical Research Direction, Gustave Roussy Cancer Campus, Université Paris-Saclay, Villejuif, France. 6 INSERM U1015, Gustave Roussy Cancer Campus, Université Paris-Saclay, Villejuif, France. 7 Equipe SiRIC RTOP Recherche Translationelle en Oncologie Pédiatrique, Institut Curie, Paris, France 8 Biostatistics and Epidemiology Unit, Gustave Roussy Cancer Campus, INSERM U1018, CESP, Université Paris-Saclay,
Villejuif, France
9 Laboratory of Translational Research in Child and Adolescent Cancer, Vall d’Hebron Research Institute (VHIR)-UAB,
Barcelona, Spain.
10 Institut Curie Genomics of Excellence (ICGex) Platform, Research Center, Institut Curie, Paris, France.
11 Department of Pathology, PSL Research University, Institut Curie, Paris, France.

12 Department of Pediatric Oncology, Institut d’Hematologie et d’Oncologie Pédiatrique/Centre Léon Bérard, Lyon, France.
13 Department of Pediatric Hematology & Oncology, Hôpital de La Timone, AP-HM, Marseille, France. 14 UMR Inserm 1068, CNRS UMR 7258, Aix Marseille Université U105, Marseille Cancer Research Center (CRCM),
Marseille, France.
15 SIREDO Oncology Center (Care, Innovation and Research for Children and AYA with Cancer), Institut Curie, PSL
Research University, Paris, France.
16 Department of Pediatric Oncology, Centre Hospitalier Universitaire, Nantes, France.
17 Pediatric Oncology Unit, Fondazione IRCCS Istituto Nazionale Tumori, Milano, Italy.
18 Paediatric Haematology/Oncology, Children’s Health Ireland, Crumlin, Dublin, Republic of Ireland. 19 Division of Paediatric Haematology and Oncology, Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR), Vall d’Hebron Hospital
Universitari, Vall d’Hebron Barcelona Hospital Campus, Barcelona, Spain.

A propos de Gustave Roussy

Classé premier centre européen et cinquième mondial dans la lutte contre le cancer, Gustave Roussy
constitue un pôle d’expertise globale entièrement dédié aux patients atteints de cancer. L’Institut est un pilier
fondateur du biocluster en oncologie Paris Saclay Cancer Cluster. Source d’innovations thérapeutiques et
d’avancées diagnostiques, l’Institut accueille près de 50 000 patients chaque année et développe une
approche intégrée entre recherche, soins et enseignement. Expert des cancers rares et des tumeurs
complexes, Gustave Roussy traite tous les cancers, à tous les âges de la vie. Il propose à ses patients une
prise en charge personnalisée qui allie innovation et humanité, où sont pris en compte le soin mais aussi la
qualité de vie physique, psychologique et sociale. Avec 3 200 professionnels répartis sur deux sites, Villejuif
et Chevilly-Larue, Gustave Roussy réunit les expertises indispensables à une recherche de haut niveau en
cancérologie ; un quart des patients traités sont inclus dans des essais cliniques.
Pour en savoir plus sur Gustave Roussy et suivre les actualités de l’Institut : www.gustaveroussy.fr, Twitter,
Facebook, LinkedIn, Instagram

A propos de l’Institut Curie

L’Institut Curie, 1er centre français de lutte contre le cancer, associe un centre de recherche de renommée
internationale et un ensemble hospitalier de pointe qui prend en charge tous les cancers y compris les plus
rares. Fondé en 1909 par Marie Curie, l’Institut Curie rassemble sur 3 sites (Paris, Saint-Cloud et Orsay) 3
700 chercheurs, médecins et soignants autour de ses 3 missions : soins, recherche et enseignement.
Fondation privée reconnue d’utilité publique habilitée à recevoir des dons et des legs, l’Institut Curie peut,
grâce au soutien de ses donateurs, accélérer les découvertes et ainsi améliorer les traitements et la qualité
de vie des malades. Pour en savoir plus : curie.fr